МФК «Динамо» был основан 8 мая 2002 года, но, несмотря на столь юный возраст по сравнению с другими командами, клуб не раз удивлял спортивную общественность и радовал болельщиков своими успехами, а в 2007 году стал Обладателем кубка УЕФА.

Сотрудничество клуба с компанией «АВМ СПОРТ» началось в 2008 году, когда он завоевал титул бронзового призера Кубка УЕФА по футзалу и 6-ти-кратного чемпиона России. Летом 2008 года команда заключила договор о сотрудничестве с Ямало-Ненецким автономным округом, и команда получила название «Динамо-Ямал».

В 2009 году «Динамо-Ямал» стал четырехкратным обладателем Кубка России по футзалу.

Сезон-2009/10 стал для динамовцев, пожалуй, самым трудным за всё время существования клуба, но не смотря на все сложности, футболисты «Динамо-Ямал» проявили свой характер и вписали ещё одну достойную страницу в историю клуба, защитив титул обладателей Кубка России.

Летом 2010 года команда вернула себе прежнее название – «Динамо».

В 2011 году МФК «Динамо» становится Чемпионом России и в шестой раз завоевывает Кубок России.

В сезоне-2012/13 впервые в истории МФК «Динамо» впервые в истории оформил победный хет-трик в экипировке бренда Umbro. Первым динамовцам покорился Кубок России, а за ним и Чемпионат России. На волне успеха команда также стала обладателем Межконтинентального кубка.

В 2016 году «Динамо» стал обладателем Суперкубка России.  Это чемпионство стало десятым для «Динамо» за 14 лет существования клуба. Таким достижением не может похвастаться ни одна команда мира. 

За долгие годы сотрудничества МФК «Динамо» завоевал 15 кубков и трофеев в экипировке Umbro:

• Чемпион России 2008, 2011-2013, 2016, 2017.
• Обладатель Кубка России 2008-2011, 2013-2015.
• Обладатель Межконтинентального кубка 2013.
• Обладатель Суперкубка России 2016.